Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q6P435 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6P435 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6P435 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q6P435 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q6P435 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
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