Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VIRMAQ69YN4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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