Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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SAMD13Q5VXD3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SAMD13Q5VXD3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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