Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DCAF6Q58WW2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms