Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
TAF1AQ15573 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms