Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKIV2LQ15477 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms