Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SEC23BQ15437 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SEC23BQ15437 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SEC23BQ15437 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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