Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms