Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ARHGEF6Q15052 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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ARHGEF6Q15052 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARHGEF6Q15052 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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