Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEUROD1Q13562 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEUROD1Q13562 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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