Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ATRQ13535 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ATRQ13535 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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