Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
LSAMPQ13449 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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