Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLTCQ00610 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms