Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP2C1P98194 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms