Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TMF1P82094 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMF1P82094 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMF1P82094 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms