Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVK-24P63145 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ERVK-24P63145 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 541.4 ms