Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FLNB-201ENST00000295956 9463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 CAMK2B-209ENST00000395749 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HERVK_113P61574 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms