Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CABP4P57796 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CABP4P57796 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms