Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC122694.1-201ENST00000510987 563 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA4P51532 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms