Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCA2P51531 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms