Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP4P49662 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms