Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GRIK1P39086 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms