Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PPARGP37231 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms