Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CDC27P30260 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC27P30260 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC27P30260 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CDC27P30260 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms