Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP1P29466 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms