Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VAV1P15498 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VAV1P15498 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VAV1P15498 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VAV1P15498 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VAV1P15498 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms