Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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ESRRAP11474 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ESRRAP11474 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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ESRRAP11474 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ESRRAP11474 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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