Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPFIA3O75145 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms