Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PRKAB2O43741 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms