Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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HOXA3O43365 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
HOXA3O43365 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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