Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXA2O43364 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms