Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NEDD8-MDP1E9PL57 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms