Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GOLGA6BA6NDN3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA6BA6NDN3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms