Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCN11AQ9UI33 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms