Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PPARGC1AQ9UBK2 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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