Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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PRDM5Q9NQX1 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRDM5Q9NQX1 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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