Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ARFGAP3Q9NP61 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms