Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3GQ9HC16 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3GQ9HC16 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms