Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC239859.4-201ENST00000582255 675 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MIA-RAB4B-201ENST00000600729 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 DUSP22-206ENST00000603453 804 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PTMAP5-202ENST00000607242 1162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012186.3-201ENST00000623850 485 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC012158.1-201ENST00000535684 1366 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP2-4Q9BYR9 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms