Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NUP88Q99567 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NUP88Q99567 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms