Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
FAM19A4Q96LR4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms