Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HDAC11Q96DB2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HDAC11Q96DB2 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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