Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PHF3Q92576 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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