Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC12Q8WUD4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC12Q8WUD4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms