Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC112Q8NEF3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms