Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC117Q8IWD4 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC117Q8IWD4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms