Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC149Q6ZUS6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms