Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
BEND4Q6ZU67 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms