Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC174Q6PII3 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms