Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MED27Q6P2C8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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MED27Q6P2C8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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MED27Q6P2C8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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MED27Q6P2C8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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